Clasificación del Reino Fungi

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Parece comprobado que se trata de un Reino monofilético. Hay 5 divisiones determinadas recientemente a partir de secuenciación del ADN, que comentaremos brevemente:
Allomyces , Quitridiomycete
Mucor mucedo. Zigomycete
Glomeromycete
  1. Quitridiomicetes: Cenocíticos, acuáticos, con alternancia de generaciones haploide-diploide, producen cuerpos fructíferos donde ser forman las esporas (esporangios) y como particularidad del grupo sus gametos son móviles (el resto de los hongos carece de flagelos).
  2. Zigomicetes: Hifas cenocíticas, producen esporas  sexuales de resistencia (zigosporas) y esporas asexuales. Moho del pan.
  3. Glomeromicetes: no tienen reproducción sexual y siempre son endosimbiontes de raíces de plantas formando las micorrizas.
  4. Ascomicetes: Micelios formados por hifas divididas por septos perforados. Reproducción asexual por esporas llamadas conidios, y reproducción sexual mediante ascosporas en el interior de estructuras llamadas ascos.
  5. Basidiomicetes: Hifas septadas que tras la reproducción sexual originan un cuerpo fructífero denominado seta, donde se encuentran los basidios, estructuras formadoras de basidiosporas, situados en láminas o en tubos.
Peziza, Ascomycete
Amanita phalloides , Basidiomycete

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